A Deluxe kiadás az alapjátékon felül 6 új pályát és 4 új karaktercsomagot tartalmaz. A LEGO Marvel Super Heroes 2 egy vadonatúj, eredeti kaland és folytatása a nagy sikerű LEGO Marvel Super Heroes játéknak. A játék egyesíti a különböző korszakokból és valóságokból származó ikonikus Marvel Szuperhősöket és Szupergonoszokat, a LEGO védjegyévé vált humorral együtt, és egy kozmikus csatába repíti a játékosokat, amely az időn és téren kívüli számos Marvel helyszínen zajlik az hihetetlen Chronopolis nyitott világában. A játékosok szemtől szembe kerülnek Kang, a Hódítóval, az időutazó ellenséggel, egy epikus csatában Chronopolis különböző helyszínein, az Ókori Egyiptomtól és a Vadnyugattól kezdve a Sakaar-on át egészen a 2099-es New York City-ig. Útjuk során a játékosok irányíthatnak számos ikonikus karaktert, mint például a múltból származó Cowboy Amerika Kapitányt vagy a jövőből érkező Pókember 2099-et, valamint Thort, Hulkot, a Galaxis Őrzőit, Fekete Párducot, Marvel Kapitányt, Doctor Strange-t, Zöld Manót és több tucatnyi más Marvel Szuperhőst és Szupergonoszt.